Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms