Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms