Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms