Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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