Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms