Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms