Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms