Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ddx28Q9CWT6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ddx28Q9CWT6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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