Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms