Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms