Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms