Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms