Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms