Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msmo1Q9CRA4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms