Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CR55 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CR55 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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