Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl28Q9CR40 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms