Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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