Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd1Q9CQK7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms