Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms