Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms