Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms