Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE3

Mrps17, 28S ribosomal protein S17, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps17Q9CQE3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps17Q9CQE3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms