Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms