Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms