Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpsQ9CQC2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms