Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpd52l3Q9CQ14 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms