Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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