Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms