Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms