Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim26Q99PN3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim26Q99PN3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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