Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms