Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc4Q99PH1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms