Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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