Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930550L24RikQ99PA7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms