Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms