Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramel1Q99MW3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms