Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abtb1Q99LJ2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abtb1Q99LJ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms