Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms