Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Sh3bp5lQ99LH9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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