Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RtcbQ99LF4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms