Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms