Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms