Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep3Q99KK1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms