Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms