Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms