Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms