Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms