Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms