Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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