Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms